黑小米营养价值非常高，是一种安全性较高的食材。黑小米作为黑色食品中的典型代表，其富含的功能性色素成分抗氧化作用非常优秀。

黑小米是很好的蛋白质营养源，其色氨酸含量非常高，色氨酸在人体内通过生物转化生成一类重要的物质，发挥着调节睡眠、情绪及生物节律等重要的生理作用，食用色氨酸含量丰富的食物可起到催眠的作用，同时小米蛋白是一种低过敏性蛋白，非常安全。

黑小米富含多种维生素，其中维生素A和B1含量最高。缺乏维生素A 会引起皮肤干燥、呼吸道感染、眼部干燥等症状，而维生素B1缺乏则可能出现体虚疲倦、便秘等。另有研究发现，补充维生素B1对于预防和缓解心肌病具有显著疗效。

黑小米中矿物质含量丰富，尤其是锌元素含量高，在常见的黑色食品中仅次于黑麦。另外，黑小米中镁元素和钾元素含量也很丰富，同时还富含被誉为“抗癌之王”的硒元素。

黑小米无论是煮饭或熬粥都容易被人体消化吸收，消化吸收率高达97,4%。

中医学认为，用黑小米熬的粥是产妇和病人的理想食物，有促进食欲，补脾养胃，滋养肾气，补虚损之作用。